Stopiņu ambulance Stopiņu ciema Desās tika atvērta 1959.gadā.
1977.gadā Stopiņu ambulance tika iekārtota Ulbrokā, Acones ielā 1.
1982.gadā Stopiņu ambulance pārcēlās uz telpām Ulbrokā, Institūta ielā 20 (bijusī zinātniskā institūta ēdnīca), kur tā atrodas arī šobrīd.
Kā patstāvīga juridiskā persona Stopiņu ambulance reģistrēta LR Uzņēmumu reģistrā 1994.gada 4.oktobrī, uz Stopiņu pagasta pašvaldības ambulances bāzes, nododot to Rīgas rajona Padomes pakļautībā.
1998.gadā ambulance vēlreiz maina pakļautību – no Rīgas rajona Padomes tiek atkal nodota Stopiņu pagasta Padomei.
2004.gadā ambulance no pašvaldības bezpeļņas uzņēmuma tiek pārveidota par pašvaldības aģentūru.
2008.gadā tiek izveidota struktūrvienība – Upesleju doktorāts
2009.gadā ambulances struktūrvienība Sauriešu medpunkts tiek likvidēts un tā vietā izveidota ārsta privātprakse.
2022.gadā veikts Stopiņu ambulances ēkas rekonstrukcija un piebūve.
Pašlaik Stopiņu ambulancē un tās struktūrvienībā darbojas četri ģimenes ārsti, ginekologs, fizioterapeits.
Stopiņu ambulances telpās pieņem arī zobārsts, pulmonologs un homeopāts.